27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32890  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158478  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2798  putative lipoprotein  98.63 
 
 		 73 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.362317  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4527  hypothetical protein  69.86 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1742  hypothetical protein  63.01 
 
 		 73 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2350  lipoprotein, putative  67.57 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2134  hypothetical protein  67.57 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3963  hypothetical protein  63.01 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0929  hypothetical protein  65.75 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1638  hypothetical protein  65.75 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24880  putative lipoprotein  71.23 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2127  putative lipoprotein  71.23 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3620  hypothetical protein  67.12 
 
 		 73 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.242629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2121  putative lipoprotein  67.12 
 
 		 73 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1662  hypothetical protein  64.38 
 
 		 73 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2366  lipoprotein, putative  43.66 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2150  hypothetical protein  42.25 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000748705  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72900  putative lipoprotein  44.78 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6327  putative lipoprotein  44.78 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2688  hypothetical protein  40.38 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252919  hitchhiker  0.000204725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0594  hypothetical protein  31.43 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0086  hypothetical protein  28.38 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0086  hypothetical protein  28.38 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0090  hypothetical protein  28.38 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.35009 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0087  hypothetical protein  28.38 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.495036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2995  protein of unknown function DUF903  29.58 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0089  hypothetical protein  28.38 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2579  hypothetical protein  26.56 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127117  hitchhiker  0.00104858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>