56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4527 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4527  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0929  hypothetical protein  86.11 
 
 		 72 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2350  lipoprotein, putative  70.27 
 
 		 74 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2134  hypothetical protein  70.27 
 
 		 74 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3963  hypothetical protein  76.27 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2798  putative lipoprotein  74.58 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.362317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32890  hypothetical protein  74.58 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158478  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1742  hypothetical protein  64.38 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1638  hypothetical protein  61.64 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24880  putative lipoprotein  73.58 
 
 		 73 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2127  putative lipoprotein  73.58 
 
 		 73 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1662  hypothetical protein  73.58 
 
 		 73 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2121  putative lipoprotein  73.58 
 
 		 73 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3620  hypothetical protein  73.58 
 
 		 73 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.242629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2366  lipoprotein, putative  46.38 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2150  hypothetical protein  44.93 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000748705  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72900  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6327  putative lipoprotein  43.28 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2688  hypothetical protein  39.22 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252919  hitchhiker  0.000204725 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0090  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.35009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0086  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0086  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0087  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.495036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0089  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3806  hypothetical protein  36.62 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638343  unclonable  0.0000000198345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3827  hypothetical protein  31.88 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00127821  normal  0.447388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3378  protein of unknown function DUF903  32.35 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0926  hypothetical protein  32.84 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000581798  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05819  hypothetical protein  34.43 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127117  hitchhiker  0.00104858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2995  protein of unknown function DUF903  33.82 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3172  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0402185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3154  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0064059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3220  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0872194  hitchhiker  0.00083353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1575  hypothetical protein  31.82 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1764  hypothetical protein  31.82 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3235  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00978662  hitchhiker  0.00000128975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1756  hypothetical protein  31.82 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00665252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3335  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0912863  hitchhiker  0.00963527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3274  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000879624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4100  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000614295  hitchhiker  0.000976754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02642  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000197879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0857  protein of unknown function DUF903  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000668343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3029  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2981  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00287278  hitchhiker  0.00772331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0882  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0181555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3153  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000699395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2980  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02681  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000141859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3401  protein of unknown function DUF903  30.43 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000105559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3129  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000119893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3146  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000180237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0360225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3209  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00813099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3309  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00054484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>