22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2366 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2366  lipoprotein, putative  100 
 
 		 74 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2150  hypothetical protein  91.89 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000748705  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2688  hypothetical protein  63.51 
 
 		 74 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252919  hitchhiker  0.000204725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0929  hypothetical protein  46.38 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3963  hypothetical protein  45.07 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1742  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4527  hypothetical protein  46.38 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72900  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6327  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2350  lipoprotein, putative  46.77 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2134  hypothetical protein  46.77 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32890  hypothetical protein  45.61 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158478  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2798  putative lipoprotein  45.61 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.362317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3620  hypothetical protein  47.06 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.242629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2121  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1662  hypothetical protein  45.1 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2127  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24880  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1638  hypothetical protein  45.1 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1756  hypothetical protein  32.76 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00665252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1764  hypothetical protein  32.76 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1575  hypothetical protein  32.76 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133962  n/a   
 
 
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