63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2579 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2579  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127117  hitchhiker  0.00104858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3235  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00978662  hitchhiker  0.00000128975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3172  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0402185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3220  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0872194  hitchhiker  0.00083353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3154  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0064059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3274  hypothetical protein  47.22 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000879624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3335  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0912863  hitchhiker  0.00963527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3827  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00127821  normal  0.447388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02681  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000141859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2981  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00287278  hitchhiker  0.00772331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3029  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0882  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0181555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3806  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638343  unclonable  0.0000000198345 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3153  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000699395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4100  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000614295  hitchhiker  0.000976754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2980  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02642  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000197879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3401  protein of unknown function DUF903  50.72 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000105559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0857  protein of unknown function DUF903  45.83 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000668343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0926  hypothetical protein  45.59 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000581798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3378  protein of unknown function DUF903  46.97 
 
 		 73 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0900  hypothetical protein  50.85 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00652326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2995  protein of unknown function DUF903  46.38 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3201  protein of unknown function DUF903  51.79 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00302253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02660  hypothetical protein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3061  putative lipoprotein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4074  putative lipoprotein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000281927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2950  putative lipoprotein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0903  hypothetical protein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3115  putative lipoprotein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2953  putative lipoprotein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02621  hypothetical protein  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0879  protein of unknown function DUF903  47.69 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3021  protein of unknown function DUF903  50 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00037767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3255  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0963  hypothetical protein  52.73 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1764  hypothetical protein  40.85 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1700  hypothetical protein  43.33 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0250469  normal  0.453188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1703  hypothetical protein  43.33 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00741738  normal  0.280007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1575  hypothetical protein  40.85 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3209  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00813099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3309  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00054484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3129  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000119893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3146  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000180237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3194  hypothetical protein  43.75 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0360225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3179  protein of unknown function DUF903  39.71 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.854338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0594  hypothetical protein  46.15 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1756  hypothetical protein  39.44 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00665252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0087  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.495036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0090  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.35009 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0086  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0086  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0089  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05819  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0334  hypothetical protein  37.88 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1742  hypothetical protein  34.85 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000185  hypothetical protein  38.3 
 
 		 47 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000611291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2350  lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3963  hypothetical protein  34.43 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0929  hypothetical protein  28.99 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1798  hypothetical protein  34.92 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.467044  normal  0.372987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>