61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02681 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02681  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000141859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0857  protein of unknown function DUF903  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000668343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3029  putative lipoprotein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2981  putative lipoprotein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00287278  hitchhiker  0.00772331 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02642  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000197879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0882  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0181555  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4100  putative lipoprotein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000614295  hitchhiker  0.000976754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3153  putative lipoprotein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000699395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2980  putative lipoprotein  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3274  hypothetical protein  95.83 
 
 
72 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000879624  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3235  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00978662  hitchhiker  0.00000128975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3220  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0872194  hitchhiker  0.00083353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3172  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0402185  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3154  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0064059  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3335  hypothetical protein  90.28 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0912863  hitchhiker  0.00963527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3827  hypothetical protein  68.06 
 
 
72 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00127821  normal  0.447388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3401  protein of unknown function DUF903  61.9 
 
 
72 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000105559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2953  putative lipoprotein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02660  hypothetical protein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0879  protein of unknown function DUF903  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3061  putative lipoprotein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0900  hypothetical protein  61.9 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00652326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2950  putative lipoprotein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110567  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0903  hypothetical protein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02621  hypothetical protein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4074  putative lipoprotein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000281927  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3115  putative lipoprotein  59.72 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3146  putative lipoprotein  59.15 
 
 
75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000180237  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3129  putative lipoprotein  59.15 
 
 
75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000119893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3194  hypothetical protein  59.15 
 
 
75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0360225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3309  putative lipoprotein  59.15 
 
 
75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00054484  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3209  putative lipoprotein  59.15 
 
 
75 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00813099  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3806  hypothetical protein  52.78 
 
 
74 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638343  unclonable  0.0000000198345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3255  hypothetical protein  54.17 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3201  protein of unknown function DUF903  58.82 
 
 
72 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00302253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3179  protein of unknown function DUF903  50.7 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.854338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0926  hypothetical protein  47.89 
 
 
73 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000581798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3378  protein of unknown function DUF903  49.28 
 
 
73 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3021  protein of unknown function DUF903  54.55 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00037767  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1764  hypothetical protein  48.61 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133159  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1575  hypothetical protein  48.61 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1756  hypothetical protein  47.22 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00665252  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1700  hypothetical protein  49.15 
 
 
62 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0250469  normal  0.453188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1703  hypothetical protein  49.15 
 
 
62 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00741738  normal  0.280007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2579  hypothetical protein  45.83 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127117  hitchhiker  0.00104858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0594  hypothetical protein  52.31 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0089  hypothetical protein  43.66 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0963  hypothetical protein  51.85 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0087  hypothetical protein  43.66 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.495036  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0086  hypothetical protein  43.66 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0090  hypothetical protein  43.66 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.35009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0086  hypothetical protein  43.66 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2995  protein of unknown function DUF903  39.13 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05819  hypothetical protein  40.3 
 
 
69 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000185  hypothetical protein  42.55 
 
 
47 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1742  hypothetical protein  37.1 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3963  hypothetical protein  31.43 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0929  hypothetical protein  28.99 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4527  hypothetical protein  30.43 
 
 
72 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2134  hypothetical protein  30.77 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21431  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2350  lipoprotein, putative  30.77 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>