41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1876 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1876  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06011  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.845171 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05491  hypothetical protein  84.82 
 
 
258 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08041  hypothetical protein  83.66 
 
 
256 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1617  hypothetical protein  79.46 
 
 
262 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.216842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0749  hypothetical protein  79.69 
 
 
261 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.352203 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0547  hypothetical protein  81.86 
 
 
256 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.927734  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05731  hypothetical protein  82.83 
 
 
256 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06031  hypothetical protein  82.83 
 
 
256 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06111  hypothetical protein  84.07 
 
 
256 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.263609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1048  hypothetical protein  67.02 
 
 
204 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0404012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0851  hypothetical protein  64 
 
 
205 aa  278  6e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0903  microcompartments protein  60.78 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1659  microcompartments protein  62.44 
 
 
204 aa  271  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1974  hypothetical protein  60.59 
 
 
210 aa  265  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4346  hypothetical protein  60.1 
 
 
210 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5816  microcompartments protein  52.49 
 
 
212 aa  178  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.799271  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3094  microcompartments protein  47.98 
 
 
213 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3396  microcompartments protein  45.77 
 
 
212 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0498  hypothetical protein  44 
 
 
205 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4090  microcompartments protein  47 
 
 
213 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0200288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4051  microcompartments protein  47 
 
 
213 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1702  microcompartments protein  48.22 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0218574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0520  hypothetical protein  44.78 
 
 
213 aa  165  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4911  hypothetical protein  48.39 
 
 
213 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3341  microcompartments protein  45.81 
 
 
206 aa  161  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00179128  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3835  microcompartments protein  43.5 
 
 
212 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1241  microcompartments protein  43.32 
 
 
201 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121817  hitchhiker  0.000132399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5567  microcompartments protein  43.85 
 
 
201 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276352  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0196  microcompartments protein  41.71 
 
 
201 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0185  microcompartments protein  41.71 
 
 
201 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0205  microcompartments protein  41.71 
 
 
201 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4027  hypothetical protein  43.01 
 
 
207 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0661  microcompartments protein  38.69 
 
 
203 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684671  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2342  microcompartments protein  43.94 
 
 
209 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000010897  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0192  hypothetical protein  39.58 
 
 
217 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0181  hypothetical protein  39.58 
 
 
217 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.344127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0201  hypothetical protein  39.58 
 
 
217 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5571  hypothetical protein  39.15 
 
 
225 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.824283  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1237  hypothetical protein  39.15 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0553533  hitchhiker  0.00115187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0665  hypothetical protein  36.41 
 
 
208 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>