41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3341 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3341  microcompartments protein  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00179128  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0520  hypothetical protein  56.8 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3396  microcompartments protein  53.92 
 
 		 212 aa  201  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3094  microcompartments protein  55.67 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4051  microcompartments protein  55.45 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4090  microcompartments protein  55.45 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0200288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3835  microcompartments protein  55.45 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5816  microcompartments protein  57.22 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.799271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4911  hypothetical protein  54.9 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0851  hypothetical protein  49.26 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0903  microcompartments protein  46.38 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1702  microcompartments protein  55.72 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0218574 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0498  hypothetical protein  44.55 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1048  hypothetical protein  47.87 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0404012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1659  microcompartments protein  46.53 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4027  hypothetical protein  48.28 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05491  hypothetical protein  46.11 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06011  hypothetical protein  46.11 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.845171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1876  hypothetical protein  46.11 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4346  hypothetical protein  47.25 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1974  hypothetical protein  46.7 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06031  hypothetical protein  44.62 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05731  hypothetical protein  44.62 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0547  hypothetical protein  44.62 
 
 		 256 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.927734  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06111  hypothetical protein  44.09 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.263609  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08041  hypothetical protein  44.62 
 
 		 256 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1617  hypothetical protein  44.62 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.216842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0749  hypothetical protein  43.55 
 
 		 261 aa  157  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.352203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2342  microcompartments protein  45.54 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000010897  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0661  microcompartments protein  41.54 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684671  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0201  hypothetical protein  38.65 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0192  hypothetical protein  38.65 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0181  hypothetical protein  38.65 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.344127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1241  microcompartments protein  44.57 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121817  hitchhiker  0.000132399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5567  microcompartments protein  43.48 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0205  microcompartments protein  42.93 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0196  microcompartments protein  42.93 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0185  microcompartments protein  42.93 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5571  hypothetical protein  35.27 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.824283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0665  hypothetical protein  36.59 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1237  hypothetical protein  35.75 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0553533  hitchhiker  0.00115187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>