41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3396 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3396  microcompartments protein  100 
 
 
212 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3094  microcompartments protein  79.33 
 
 
213 aa  311  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4051  microcompartments protein  80.88 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4090  microcompartments protein  80.88 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0200288  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3835  microcompartments protein  77.36 
 
 
212 aa  300  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0520  hypothetical protein  74.29 
 
 
213 aa  300  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1702  microcompartments protein  73.83 
 
 
217 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0218574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4911  hypothetical protein  76.7 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0851  hypothetical protein  49.26 
 
 
205 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5816  microcompartments protein  55.19 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.799271  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3341  microcompartments protein  56.18 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00179128  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0498  hypothetical protein  49.01 
 
 
205 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05491  hypothetical protein  46.27 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06011  hypothetical protein  45.77 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.845171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1876  hypothetical protein  45.77 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0903  microcompartments protein  45.32 
 
 
213 aa  193  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1659  microcompartments protein  47.03 
 
 
204 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05731  hypothetical protein  48.92 
 
 
256 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06031  hypothetical protein  48.92 
 
 
256 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0547  hypothetical protein  48.92 
 
 
256 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.927734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1048  hypothetical protein  48.92 
 
 
204 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0404012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1974  hypothetical protein  49.18 
 
 
210 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08041  hypothetical protein  46.77 
 
 
256 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06111  hypothetical protein  48.39 
 
 
256 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.263609  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1617  hypothetical protein  46.27 
 
 
262 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.216842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2342  microcompartments protein  50.73 
 
 
209 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000010897  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4027  hypothetical protein  48.77 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303452  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4346  hypothetical protein  48.63 
 
 
210 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0749  hypothetical protein  45.77 
 
 
261 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.352203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1237  hypothetical protein  40.58 
 
 
221 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0553533  hitchhiker  0.00115187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5571  hypothetical protein  39.61 
 
 
225 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.824283  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0661  microcompartments protein  43.43 
 
 
203 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684671  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0201  hypothetical protein  40.58 
 
 
217 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0192  hypothetical protein  40.58 
 
 
217 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0181  hypothetical protein  40.58 
 
 
217 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.344127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0205  microcompartments protein  48.91 
 
 
201 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0185  microcompartments protein  48.91 
 
 
201 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0196  microcompartments protein  48.91 
 
 
201 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5567  microcompartments protein  47.06 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276352  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1241  microcompartments protein  47.59 
 
 
201 aa  161  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121817  hitchhiker  0.000132399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0665  hypothetical protein  37.98 
 
 
208 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>