41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0851 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0851  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  425  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0903  microcompartments protein  65.69 
 
 
213 aa  287  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1659  microcompartments protein  67.68 
 
 
204 aa  286  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1048  hypothetical protein  66.67 
 
 
204 aa  278  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0404012  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06011  hypothetical protein  64 
 
 
258 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.845171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1876  hypothetical protein  64 
 
 
258 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05491  hypothetical protein  62.5 
 
 
258 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1974  hypothetical protein  66.67 
 
 
210 aa  275  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4346  hypothetical protein  66.67 
 
 
210 aa  275  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08041  hypothetical protein  65.59 
 
 
256 aa  274  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0547  hypothetical protein  65.59 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.927734  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05731  hypothetical protein  65.59 
 
 
256 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06031  hypothetical protein  65.59 
 
 
256 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06111  hypothetical protein  64.52 
 
 
256 aa  271  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.263609  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1617  hypothetical protein  64.52 
 
 
262 aa  270  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.216842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0749  hypothetical protein  63.98 
 
 
261 aa  265  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.352203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5816  microcompartments protein  56.35 
 
 
212 aa  195  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.799271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3396  microcompartments protein  49.26 
 
 
212 aa  190  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0498  hypothetical protein  47.31 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0520  hypothetical protein  47.29 
 
 
213 aa  175  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3341  microcompartments protein  49.15 
 
 
206 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00179128  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3094  microcompartments protein  46.31 
 
 
213 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4911  hypothetical protein  47.34 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1702  microcompartments protein  47.52 
 
 
217 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0218574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3835  microcompartments protein  45.1 
 
 
212 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4090  microcompartments protein  44.33 
 
 
213 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0200288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4051  microcompartments protein  44.33 
 
 
213 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2342  microcompartments protein  47.76 
 
 
209 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000010897  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0661  microcompartments protein  37.69 
 
 
203 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684671  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0185  microcompartments protein  41.87 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0196  microcompartments protein  41.87 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0205  microcompartments protein  41.87 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4027  hypothetical protein  43.35 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1241  microcompartments protein  41.58 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121817  hitchhiker  0.000132399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5567  microcompartments protein  42.25 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5571  hypothetical protein  38.02 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.824283  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1237  hypothetical protein  36.89 
 
 
221 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0553533  hitchhiker  0.00115187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0192  hypothetical protein  39.06 
 
 
217 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0181  hypothetical protein  39.06 
 
 
217 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.344127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0201  hypothetical protein  39.06 
 
 
217 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0665  hypothetical protein  33.65 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>