41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4346 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4346  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1974  hypothetical protein  96.65 
 
 		 210 aa  394  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0903  microcompartments protein  78.54 
 
 		 213 aa  346  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0851  hypothetical protein  66.67 
 
 		 205 aa  290  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05491  hypothetical protein  61.08 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06011  hypothetical protein  60.1 
 
 		 258 aa  277  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.845171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1876  hypothetical protein  60.1 
 
 		 258 aa  277  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1659  microcompartments protein  62.12 
 
 		 204 aa  276  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08041  hypothetical protein  62.56 
 
 		 256 aa  275  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1617  hypothetical protein  63.41 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.216842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1048  hypothetical protein  64.32 
 
 		 204 aa  271  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0404012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0749  hypothetical protein  62.44 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.352203 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05731  hypothetical protein  60.75 
 
 		 256 aa  259  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06031  hypothetical protein  60.75 
 
 		 256 aa  259  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0547  hypothetical protein  60.75 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.927734  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06111  hypothetical protein  59.68 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.263609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5816  microcompartments protein  54.89 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.799271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0498  hypothetical protein  47.98 
 
 		 205 aa  184  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0520  hypothetical protein  49.04 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3094  microcompartments protein  49.5 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3396  microcompartments protein  46.34 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4051  microcompartments protein  47.32 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4090  microcompartments protein  47.32 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0200288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3341  microcompartments protein  48.57 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00179128  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3835  microcompartments protein  47.74 
 
 		 212 aa  165  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4911  hypothetical protein  48.66 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1702  microcompartments protein  48.98 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0218574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2342  microcompartments protein  47.32 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000010897  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4027  hypothetical protein  44.28 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0185  microcompartments protein  44.26 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0205  microcompartments protein  44.26 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0196  microcompartments protein  44.26 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0661  microcompartments protein  40 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.684671  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5567  microcompartments protein  42.47 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1241  microcompartments protein  42.62 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121817  hitchhiker  0.000132399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5571  hypothetical protein  37.38 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.824283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0192  hypothetical protein  38.35 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0181  hypothetical protein  38.35 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.344127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0201  hypothetical protein  38.35 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1237  hypothetical protein  36.89 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0553533  hitchhiker  0.00115187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0665  hypothetical protein  34.63 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>