29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0303 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0303  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  203  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.675894  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09751  hypothetical protein  99.02 
 
 
102 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.611374  normal  0.433211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15331  hypothetical protein  62 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08561  hypothetical protein  64 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1426  hypothetical protein  54.17 
 
 
97 aa  103  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0573286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1073  hypothetical protein  52.04 
 
 
91 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09861  hypothetical protein  52.04 
 
 
100 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09571  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0197216  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0896  hypothetical protein  49.47 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.287501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4478  hypothetical protein  50.5 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09551  hypothetical protein  46.94 
 
 
100 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1756  hypothetical protein  47.47 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  44.55 
 
 
101 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  48.42 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4049  hypothetical protein  44.79 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4011  hypothetical protein  44.79 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  46.94 
 
 
111 aa  84.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9615  predicted protein  40.45 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9544  predicted protein  39.33 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61531  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11197  predicted protein  37.08 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9601  predicted protein  37.93 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  31.58 
 
 
230 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0043  hypothetical protein  29.9 
 
 
239 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0021  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0028  hypothetical protein  32.81 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0022  hypothetical protein  27.55 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0022  hypothetical protein  22.45 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0154807  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0015  hypothetical protein  27.47 
 
 
231 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>