27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0021 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0021  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0043  hypothetical protein  73.54 
 
 
239 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0022  hypothetical protein  72.09 
 
 
224 aa  316  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0028  hypothetical protein  69.6 
 
 
228 aa  310  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0022  hypothetical protein  63.93 
 
 
229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0154807  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  62.56 
 
 
230 aa  294  9e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0015  hypothetical protein  63.89 
 
 
231 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  31.33 
 
 
101 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4050  hypothetical protein  37.25 
 
 
99 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4477  hypothetical protein  36.46 
 
 
93 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4012  hypothetical protein  37.25 
 
 
99 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  30.59 
 
 
102 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  30.49 
 
 
111 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4011  hypothetical protein  25.25 
 
 
100 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4049  hypothetical protein  25.25 
 
 
100 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1757  hypothetical protein  36.19 
 
 
106 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4478  hypothetical protein  29.79 
 
 
109 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  35.29 
 
 
109 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0791  hypothetical protein  35.87 
 
 
98 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10662  predicted protein  38.55 
 
 
86 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0262424 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08561  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0921  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15331  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1756  hypothetical protein  28.92 
 
 
105 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_8301  predicted protein  40.79 
 
 
80 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9615  predicted protein  24.72 
 
 
91 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2745  hypothetical protein  38.71 
 
 
96 aa  41.6  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>