32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0034 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0028  hypothetical protein  72.49 
 
 
228 aa  319  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0021  hypothetical protein  62.56 
 
 
237 aa  294  8e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0043  hypothetical protein  63.68 
 
 
239 aa  288  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0015  hypothetical protein  60.7 
 
 
231 aa  281  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0022  hypothetical protein  60.53 
 
 
224 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0022  hypothetical protein  57.64 
 
 
229 aa  272  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0154807  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  33.68 
 
 
111 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  35.24 
 
 
109 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9615  predicted protein  30.34 
 
 
91 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4478  hypothetical protein  31.63 
 
 
109 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4050  hypothetical protein  37.37 
 
 
99 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4011  hypothetical protein  26.6 
 
 
100 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4012  hypothetical protein  37.37 
 
 
99 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4049  hypothetical protein  26.6 
 
 
100 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15331  hypothetical protein  30.43 
 
 
100 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4477  hypothetical protein  37.63 
 
 
93 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0791  hypothetical protein  39.13 
 
 
98 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1756  hypothetical protein  30.11 
 
 
105 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0303  hypothetical protein  32.61 
 
 
102 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.675894  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09751  hypothetical protein  32.61 
 
 
102 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.611374  normal  0.433211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1757  hypothetical protein  38.04 
 
 
106 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09861  hypothetical protein  26.37 
 
 
100 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09571  hypothetical protein  29.79 
 
 
100 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0197216  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2745  hypothetical protein  32.65 
 
 
96 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0896  hypothetical protein  25.81 
 
 
100 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.287501  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1073  hypothetical protein  28.89 
 
 
91 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3373  hypothetical protein  34.38 
 
 
96 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10662  predicted protein  40.32 
 
 
86 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0262424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0921  hypothetical protein  31.31 
 
 
100 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>