23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1073 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1073  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1426  hypothetical protein  85.88 
 
 
97 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0573286 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15331  hypothetical protein  60.42 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08561  hypothetical protein  55.91 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011717 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0303  hypothetical protein  52.04 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.675894  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09861  hypothetical protein  47.96 
 
 
100 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  93.6  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09571  hypothetical protein  50.54 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0197216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09751  hypothetical protein  51.02 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.611374  normal  0.433211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  60 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  56.18 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09551  hypothetical protein  48.96 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0896  hypothetical protein  49.44 
 
 
100 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.287501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1756  hypothetical protein  56.67 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4478  hypothetical protein  59.55 
 
 
109 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4011  hypothetical protein  55.56 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4049  hypothetical protein  55.56 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  54.44 
 
 
101 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9615  predicted protein  41.76 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9544  predicted protein  42.86 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61531  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11197  predicted protein  38.46 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9601  predicted protein  37.5 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  28.89 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>