23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0043 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0043  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  480  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0021  hypothetical protein  73.54 
 
 
237 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0028  hypothetical protein  69.86 
 
 
228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0022  hypothetical protein  66.37 
 
 
224 aa  301  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0022  hypothetical protein  63.47 
 
 
229 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0154807  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  63.68 
 
 
230 aa  288  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0015  hypothetical protein  57.27 
 
 
231 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  31.91 
 
 
101 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  32.69 
 
 
109 aa  52  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  29.47 
 
 
102 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  29.47 
 
 
111 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10662  predicted protein  39.51 
 
 
86 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0262424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1757  hypothetical protein  36.49 
 
 
106 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4011  hypothetical protein  26.04 
 
 
100 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4049  hypothetical protein  26.04 
 
 
100 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4477  hypothetical protein  34.44 
 
 
93 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15331  hypothetical protein  26.8 
 
 
100 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4478  hypothetical protein  32.97 
 
 
109 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4050  hypothetical protein  32.69 
 
 
99 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4012  hypothetical protein  32.38 
 
 
99 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0303  hypothetical protein  29.9 
 
 
102 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.675894  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9615  predicted protein  35.09 
 
 
91 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1756  hypothetical protein  29.03 
 
 
105 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>