30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0028 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0028  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  72.49 
 
 
230 aa  334  7e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0021  hypothetical protein  69.6 
 
 
237 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0043  hypothetical protein  69.86 
 
 
239 aa  319  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0015  hypothetical protein  66.52 
 
 
231 aa  311  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0022  hypothetical protein  58.74 
 
 
229 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0154807  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0022  hypothetical protein  61.54 
 
 
224 aa  288  6e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  32.29 
 
 
101 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15331  hypothetical protein  30.93 
 
 
100 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  31.58 
 
 
102 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4012  hypothetical protein  34.34 
 
 
99 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  30.93 
 
 
111 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4050  hypothetical protein  34.34 
 
 
99 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9615  predicted protein  31.4 
 
 
91 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0253902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0791  hypothetical protein  34.02 
 
 
98 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4477  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4049  hypothetical protein  26.32 
 
 
100 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4011  hypothetical protein  26.32 
 
 
100 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1756  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0921  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08561  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4478  hypothetical protein  45.45 
 
 
109 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09751  hypothetical protein  30.93 
 
 
102 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.611374  normal  0.433211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1757  hypothetical protein  31.73 
 
 
106 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3373  hypothetical protein  32.99 
 
 
96 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9544  predicted protein  29.41 
 
 
91 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61531  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0303  hypothetical protein  29.9 
 
 
102 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.675894  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2745  hypothetical protein  29.59 
 
 
96 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08551  hypothetical protein  31.87 
 
 
108 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>