More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80857 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_80857  predicted protein  100 
 
 
255 aa  500  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.259031 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10278  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07300)  63.6 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19095  normal  0.236611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  62.25 
 
 
249 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  294  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.13 
 
 
249 aa  292  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.57 
 
 
249 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.17 
 
 
249 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.76 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.35 
 
 
249 aa  284  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.35 
 
 
249 aa  284  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.35 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.76 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  58.7 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.98 
 
 
249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  60.16 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.35 
 
 
248 aa  281  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.35 
 
 
248 aa  281  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.11 
 
 
249 aa  279  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.94 
 
 
249 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.11 
 
 
249 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.3 
 
 
249 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.09 
 
 
249 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.94 
 
 
248 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.7 
 
 
249 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.7 
 
 
249 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.09 
 
 
249 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.89 
 
 
249 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.16 
 
 
249 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  60.16 
 
 
249 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.35 
 
 
249 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  59.35 
 
 
249 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.76 
 
 
249 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.76 
 
 
249 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.35 
 
 
249 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  59.35 
 
 
249 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.35 
 
 
249 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.3 
 
 
249 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.49 
 
 
249 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.35 
 
 
249 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.28 
 
 
249 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.54 
 
 
249 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.49 
 
 
249 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.3 
 
 
249 aa  275  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.91 
 
 
249 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.87 
 
 
249 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.13 
 
 
249 aa  274  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.49 
 
 
249 aa  274  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.3 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.49 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  58.94 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.89 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.89 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.13 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.49 
 
 
249 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.49 
 
 
249 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.54 
 
 
249 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.26 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.85 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.94 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  55.12 
 
 
252 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.3 
 
 
249 aa  271  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.3 
 
 
249 aa  271  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.49 
 
 
256 aa  271  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.47 
 
 
249 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.09 
 
 
249 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.28 
 
 
249 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.54 
 
 
252 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.7 
 
 
249 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.28 
 
 
249 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.68 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.28 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.91 
 
 
249 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.06 
 
 
446 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.09 
 
 
249 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.09 
 
 
249 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.33 
 
 
252 aa  268  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.89 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.6 
 
 
253 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.09 
 
 
249 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.28 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.68 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.28 
 
 
249 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  59.92 
 
 
249 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.32 
 
 
249 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.09 
 
 
249 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.68 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.09 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.68 
 
 
249 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02100  mitochondrion protein, putative  53.82 
 
 
265 aa  265  5.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.28 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.28 
 
 
249 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>