28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62249 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63238  Probable sucrose utilization protein SUC1  73.88 
 
 
544 aa  763    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89671  zinc finger protein possibly regulating maltose complex or other sugar transporters  67.91 
 
 
525 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62249  Fungal transcriptional regulatory protein  100 
 
 
482 aa  1007    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_3849  Probable sucrose utilization protein  50.41 
 
 
487 aa  507  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.411737  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_17775  Probable sucrose utilization protein (SUC1) or maltose fermentation regulatory protein (MAL13)  44.35 
 
 
452 aa  402  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08596  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  26.32 
 
 
521 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07346  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.38 
 
 
584 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.545728  normal  0.644671 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02016  AmyR proteinAmylase cluster transcriptional regulator AmyRPutative uncharacterized protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y728]  21.1 
 
 
662 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10423  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  22.22 
 
 
521 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03835  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  22.65 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.821404  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66925  predicted protein  39.44 
 
 
1062 aa  63.5  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47398  zinc finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  52.63 
 
 
800 aa  53.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.654245  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04247  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  46.67 
 
 
634 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882499  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07610  Putative transcription factor [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J128]  41.86 
 
 
875 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08391  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.31 
 
 
479 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0317347  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07343  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  47.62 
 
 
612 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751181  normal  0.432497 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00110  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 
728 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.441864  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02700  hypothetical protein  47.73 
 
 
582 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.289743  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03510  expressed protein  22.76 
 
 
687 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30770  Fungal transcriptional regulatory protein  40 
 
 
759 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00132045  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31755  predicted protein  40 
 
 
1086 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.115021 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02672  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.86 
 
 
713 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08535  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.47 
 
 
560 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.414423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08079  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  51.85 
 
 
680 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0152693  normal  0.153171 
 
 
-
 
NC_006686  CND02010  expressed protein  30.43 
 
 
785 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00388  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40.54 
 
 
825 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  53.57 
 
 
858 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03280  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.04 
 
 
442 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00805168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>