41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_17775 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_17775  Probable sucrose utilization protein (SUC1) or maltose fermentation regulatory protein (MAL13)  100 
 
 
452 aa  930    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63238  Probable sucrose utilization protein SUC1  47.46 
 
 
544 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89671  zinc finger protein possibly regulating maltose complex or other sugar transporters  45.38 
 
 
525 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_3849  Probable sucrose utilization protein  44.28 
 
 
487 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.411737  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62249  Fungal transcriptional regulatory protein  44.35 
 
 
482 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0654828 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08596  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  27.45 
 
 
521 aa  166  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07346  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.16 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.545728  normal  0.644671 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02016  AmyR proteinAmylase cluster transcriptional regulator AmyRPutative uncharacterized protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y728]  28.68 
 
 
662 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10423  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.22 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03835  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  22.77 
 
 
594 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.821404  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66925  predicted protein  49.18 
 
 
1062 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07343  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.42 
 
 
612 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751181  normal  0.432497 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04247  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40.74 
 
 
634 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882499  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00670  nucleus protein, putative  24.03 
 
 
869 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.86397  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11185  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  50 
 
 
779 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.298239 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03650  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.14 
 
 
815 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653785 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03930  hypothetical protein  37.1 
 
 
738 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00533  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.1 
 
 
641 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.868926 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33678  predicted protein  46.34 
 
 
673 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07610  Putative transcription factor [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J128]  47.83 
 
 
875 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07507  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  44.44 
 
 
748 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05080  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 
752 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142979  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04558  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.13 
 
 
854 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02122  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.55 
 
 
649 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00393645  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10262  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.86 
 
 
556 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51603  transcription factor involved in arginine metabolism  48.57 
 
 
727 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.871981  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03385  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.85 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560023 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02852  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  33.33 
 
 
1018 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10976  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36 
 
 
715 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01134  Quinic acid utilization activator [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10563]  44.44 
 
 
825 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.524826  normal  0.226407 
 
 
-
 
NC_006686  CND02010  expressed protein  31.51 
 
 
785 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08885  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  44.44 
 
 
915 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.50205  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09221  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor, putative (Eurofung)  40.91 
 
 
822 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.196732 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00689  Acetate regulatory DNA binding protein FacBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13461]  32 
 
 
867 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02615  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  47.22 
 
 
682 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30827  component of the ARGR regulatory complex  34.92 
 
 
933 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.37287  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07820  Sterigmatocystin biosynthesis regulatory protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P52957]  48.48 
 
 
433 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.105824 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01927  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.62 
 
 
750 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08090  expressed protein  33.33 
 
 
913 aa  43.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287601  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09050  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  53.57 
 
 
538 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03390  nucleus protein, putative  35 
 
 
938 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.175447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>