26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63238 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63238  Probable sucrose utilization protein SUC1  100 
 
 
544 aa  1126    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62249  Fungal transcriptional regulatory protein  73.88 
 
 
482 aa  743    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89671  zinc finger protein possibly regulating maltose complex or other sugar transporters  78.21 
 
 
525 aa  866    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_3849  Probable sucrose utilization protein  54.14 
 
 
487 aa  547  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.411737  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_17775  Probable sucrose utilization protein (SUC1) or maltose fermentation regulatory protein (MAL13)  47.46 
 
 
452 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08596  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  26.71 
 
 
521 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07346  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24.94 
 
 
584 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.545728  normal  0.644671 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02016  AmyR proteinAmylase cluster transcriptional regulator AmyRPutative uncharacterized protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y728]  23.91 
 
 
662 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10423  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.53 
 
 
521 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66925  predicted protein  46.15 
 
 
1062 aa  64.7  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03835  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.49 
 
 
594 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.821404  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05080  conserved hypothetical protein  22.97 
 
 
752 aa  54.7  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142979  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07610  Putative transcription factor [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J128]  38.33 
 
 
875 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04247  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24.81 
 
 
634 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882499  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00388  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.3 
 
 
825 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47398  zinc finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  35 
 
 
800 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.654245  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07507  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.51 
 
 
748 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03930  hypothetical protein  28.21 
 
 
738 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00110  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
728 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.441864  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08535  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.49 
 
 
560 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.414423 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  41.67 
 
 
913 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01303  ScfA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1WD27]  41.86 
 
 
729 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467312  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07343  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  48.72 
 
 
612 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751181  normal  0.432497 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10550  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.73 
 
 
797 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08441  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.5 
 
 
749 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.739366  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08930  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.73 
 
 
792 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0637325  normal  0.205513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>