17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56356 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_56356  predicted protein  100 
 
 		 2283 aa  4633    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.614914 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00239  Beige/BEACH domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09220)  41.51 
 
 		 2483 aa  623  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.996444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01230  response to pH-related protein, putative  44.35 
 
 		 968 aa  392  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13399  predicted protein  63.07 
 
 		 252 aa  335  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_813  predicted protein  40.72 
 
 		 719 aa  317  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0197823  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41455  predicted protein  42.93 
 
 		 366 aa  316  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.291045  normal  0.0210228 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16408  predicted protein  51.6 
 
 		 252 aa  271  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10805  predicted protein  49.59 
 
 		 245 aa  243  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.689301  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9886  predicted protein  46.64 
 
 		 231 aa  221  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86630  predicted protein  28.19 
 
 		 1151 aa  76.3  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.460388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01220  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 		 1501 aa  68.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36759  protein required for amino acid permease transport from the Golgi to the cell surface  29.13 
 
 		 318 aa  50.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1807 aa  48.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  36.11 
 
 		 1097 aa  47.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  31.88 
 
 		 1280 aa  47.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40677  predicted protein  38.89 
 
 		 2243 aa  46.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1157 aa  46.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>