14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50995 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50995  predicted protein  100 
 
 
664 aa  1348    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.680545 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05450  multispanning membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13430)  34.79 
 
 
699 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475774 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23908  predicted protein  30.14 
 
 
639 aa  275  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0896713  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25752  predicted protein  30.6 
 
 
650 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47670  tocopherol cyclase  29.71 
 
 
622 aa  263  6.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00880  conserved hypothetical protein  28.11 
 
 
626 aa  210  8e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225651  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22145  predicted protein  28.3 
 
 
585 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66462  predicted protein  26.05 
 
 
636 aa  209  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12587  predicted protein  25.37 
 
 
617 aa  199  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.091239  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29586  predicted protein  27.53 
 
 
624 aa  195  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42002  predicted protein  25.77 
 
 
626 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.707722  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13662  predicted protein  23.86 
 
 
570 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26299  predicted protein  25.76 
 
 
619 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415226  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47564  predicted protein  24.32 
 
 
682 aa  63.9  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>