14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42002 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12587  predicted protein  64.23 
 
 
617 aa  832    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.091239  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42002  predicted protein  100 
 
 
626 aa  1286    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.707722  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23908  predicted protein  38.65 
 
 
639 aa  462  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0896713  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25752  predicted protein  36.29 
 
 
650 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47670  tocopherol cyclase  34.88 
 
 
622 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00880  conserved hypothetical protein  33.65 
 
 
626 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225651  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22145  predicted protein  32.9 
 
 
585 aa  326  6e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05450  multispanning membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13430)  30.89 
 
 
699 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475774 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66462  predicted protein  30.2 
 
 
636 aa  299  9e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29586  predicted protein  30.16 
 
 
624 aa  290  7e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13662  predicted protein  28.74 
 
 
570 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26299  predicted protein  30.88 
 
 
619 aa  262  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415226  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50995  predicted protein  25.77 
 
 
664 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.680545 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47564  predicted protein  23.72 
 
 
682 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>