14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47564 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47564  predicted protein  100 
 
 
682 aa  1408    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47670  tocopherol cyclase  27.99 
 
 
622 aa  209  9e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25752  predicted protein  26.07 
 
 
650 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22145  predicted protein  26.94 
 
 
585 aa  167  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23908  predicted protein  25.49 
 
 
639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0896713  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42002  predicted protein  23.72 
 
 
626 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.707722  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66462  predicted protein  22.97 
 
 
636 aa  118  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12587  predicted protein  22.64 
 
 
617 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.091239  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00880  conserved hypothetical protein  22.39 
 
 
626 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225651  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05450  multispanning membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13430)  22.04 
 
 
699 aa  82.4  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475774 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13662  predicted protein  23.19 
 
 
570 aa  81.6  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29586  predicted protein  20.57 
 
 
624 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26299  predicted protein  23.67 
 
 
619 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415226  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50995  predicted protein  24.32 
 
 
664 aa  63.9  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.680545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>