12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_4234 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_4234  predicted protein  100 
 
 
286 aa  570  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49849  predicted protein  49.83 
 
 
469 aa  254  8e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.725945  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29042  predicted protein  35.99 
 
 
385 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15438  DMT family transporter: UDP-galactose  33.09 
 
 
325 aa  97.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306391  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20120  predicted protein  29.63 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33748  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  28.02 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248456  hitchhiker  0.00153598 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_51835  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  29.55 
 
 
340 aa  79  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230907  hitchhiker  0.00000272124 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50402  DMT family transporter: CMP-sialic acid/UDP-N-acetylglucosamine  25.1 
 
 
296 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328391  normal  0.317384 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22921  predicted protein  29.5 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.858448  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04830  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 
801 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269217  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22739  predicted protein  26.71 
 
 
396 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30615  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46194  predicted protein  24.83 
 
 
399 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.792848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>