12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22921 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_22921  predicted protein  100 
 
 
337 aa  682    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.858448  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20120  predicted protein  40.38 
 
 
339 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04830  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 
801 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269217  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46194  predicted protein  33.73 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.792848  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_51835  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  31.65 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230907  hitchhiker  0.00000272124 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33748  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  31.33 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248456  hitchhiker  0.00153598 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10676  UDP-galactose transporter (Eurofung)  26.21 
 
 
450 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.552099 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22739  predicted protein  31.08 
 
 
396 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30615  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50402  DMT family transporter: CMP-sialic acid/UDP-N-acetylglucosamine  25.37 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328391  normal  0.317384 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4234  predicted protein  29.5 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49849  predicted protein  25.83 
 
 
469 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.725945  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80295  putative UDP-galactose transporter  27.34 
 
 
393 aa  46.2  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>