14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22739 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_22739  predicted protein  100 
 
 
396 aa  799    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30615  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20120  predicted protein  33.54 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22921  predicted protein  31.08 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.858448  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04830  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 
801 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269217  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_51835  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  28.66 
 
 
340 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230907  hitchhiker  0.00000272124 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33748  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  28.35 
 
 
323 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248456  hitchhiker  0.00153598 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46194  predicted protein  26.95 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.792848  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10676  UDP-galactose transporter (Eurofung)  27.64 
 
 
450 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.552099 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4234  predicted protein  26.71 
 
 
286 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49849  predicted protein  24.22 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.725945  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29042  predicted protein  26.79 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50402  DMT family transporter: CMP-sialic acid/UDP-N-acetylglucosamine  22.92 
 
 
296 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328391  normal  0.317384 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15438  DMT family transporter: UDP-galactose  27.5 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306391  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  32.79 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>