11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29042 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_29042  predicted protein  100 
 
 
385 aa  780    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4234  predicted protein  36.05 
 
 
286 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49849  predicted protein  34.29 
 
 
469 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.725945  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15438  DMT family transporter: UDP-galactose  31.35 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306391  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20120  predicted protein  25.71 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22739  predicted protein  26.46 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30615  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46194  predicted protein  24.44 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.792848  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_51835  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  23.42 
 
 
340 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230907  hitchhiker  0.00000272124 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04830  conserved hypothetical protein  25 
 
 
801 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269217  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22921  predicted protein  24.41 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.858448  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33748  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  23.87 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248456  hitchhiker  0.00153598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>