242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44492 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44492  predicted protein  100 
 
 
481 aa  1002    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10902  predicted protein  44.71 
 
 
473 aa  256  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  32.67 
 
 
439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0360  N-acetylglutamate synthase  30.7 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  32.01 
 
 
440 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  31.53 
 
 
444 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0329  N-acetylglutamate synthase  30.36 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.758778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  30.23 
 
 
440 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  30.89 
 
 
441 aa  114  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.781275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  30.89 
 
 
441 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  30.89 
 
 
441 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  27.95 
 
 
436 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  31.61 
 
 
435 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  30.15 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  32.27 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  31.15 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  30.38 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  31.13 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  31.35 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  29.5 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  30.38 
 
 
465 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  33.12 
 
 
442 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 
476 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0919  N-acetylglutamate synthase  30.45 
 
 
441 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3261  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
443 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  29.09 
 
 
436 aa  110  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  31.15 
 
 
439 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  30.57 
 
 
441 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  30.42 
 
 
447 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0598  N-acetylglutamate synthase  28 
 
 
453 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00244264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  31.15 
 
 
445 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  30.82 
 
 
445 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  30.82 
 
 
445 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
443 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  31.15 
 
 
439 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  31.15 
 
 
439 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  29.97 
 
 
443 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  31.15 
 
 
439 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  31.15 
 
 
439 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  30.52 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  30.52 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  30.06 
 
 
465 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  30.65 
 
 
440 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3218  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3204  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3318  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
443 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3478  N-acetylglutamate synthase  31.02 
 
 
440 aa  106  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  30.28 
 
 
451 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4083  N-acetylglutamate synthase  30.19 
 
 
443 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  30.82 
 
 
439 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  30.67 
 
 
438 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  28.5 
 
 
478 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1262  N-acetylglutamate synthase  30.88 
 
 
454 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0481247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  30.21 
 
 
460 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  29.66 
 
 
441 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  30.25 
 
 
444 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  28 
 
 
432 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0388  N-acetylglutamate synthase  30.92 
 
 
439 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0404545  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  28 
 
 
432 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  27.71 
 
 
432 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  30.39 
 
 
477 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  27.71 
 
 
432 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  28.66 
 
 
432 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  27.71 
 
 
432 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  31.03 
 
 
441 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  28.98 
 
 
440 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0713  N-acetylglutamate synthase  29.1 
 
 
437 aa  103  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0685  N-acetylglutamate synthase  30.03 
 
 
449 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.98957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1901  N-acetylglutamate synthase  29.53 
 
 
456 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  27.19 
 
 
448 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0664  N-acetylglutamate synthase  31.08 
 
 
435 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  30.15 
 
 
459 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  27.43 
 
 
432 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  27.19 
 
 
448 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0813  N-acetylglutamate synthase  31.08 
 
 
435 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  28.25 
 
 
448 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2228  N-acetylglutamate synthase  28.4 
 
 
446 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  29.13 
 
 
444 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  28.83 
 
 
446 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0688  N-acetylglutamate synthase  30.59 
 
 
454 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.127329  normal  0.447208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  29.57 
 
 
459 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  29.36 
 
 
432 aa  100  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  32.05 
 
 
448 aa  100  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  28.57 
 
 
449 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  27.22 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  27.98 
 
 
450 aa  99.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  27.51 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  27.76 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  27.76 
 
 
432 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  29.22 
 
 
459 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  28.92 
 
 
459 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  28.92 
 
 
459 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  28.92 
 
 
459 aa  97.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  28.78 
 
 
462 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>