More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3318 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  93.23 
 
 		 443 aa  860    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  93.23 
 
 		 443 aa  860    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0919  N-acetylglutamate synthase  84.81 
 
 		 441 aa  795    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3218  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 		 443 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  85.03 
 
 		 441 aa  796    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  87.07 
 
 		 441 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3261  N-acetylglutamate synthase  92.78 
 
 		 443 aa  854    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  93.23 
 
 		 443 aa  860    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3318  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 		 443 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  87.07 
 
 		 441 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4083  N-acetylglutamate synthase  93 
 
 		 443 aa  858    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  99.77 
 
 		 443 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3204  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 		 443 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  93.23 
 
 		 443 aa  860    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  93 
 
 		 443 aa  858    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  93 
 
 		 443 aa  858    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  87.07 
 
 		 441 aa  814    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.781275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  82.99 
 
 		 441 aa  772    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  93.23 
 
 		 443 aa  860    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  83.45 
 
 		 441 aa  779    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  87.53 
 
 		 441 aa  811    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  99.55 
 
 		 443 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  93.23 
 
 		 443 aa  860    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  64.84 
 
 		 445 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  64.38 
 
 		 445 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  64.61 
 
 		 445 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  64.84 
 
 		 445 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  64.61 
 
 		 439 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  64.61 
 
 		 439 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  64.61 
 
 		 439 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  64.61 
 
 		 439 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  64.61 
 
 		 439 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  64.38 
 
 		 440 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  63.7 
 
 		 439 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0329  N-acetylglutamate synthase  63.47 
 
 		 439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.758778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03295  N-acetylglutamate synthase  63.23 
 
 		 448 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0685  N-acetylglutamate synthase  64.48 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.98957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002688  N-acetylglutamate synthase  63.15 
 
 		 445 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3478  N-acetylglutamate synthase  63.47 
 
 		 440 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  62.79 
 
 		 440 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  63.24 
 
 		 439 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1901  N-acetylglutamate synthase  63.6 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0388  N-acetylglutamate synthase  62.56 
 
 		 439 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0404545  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  55.17 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  54.99 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  51.24 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  51.49 
 
 		 432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  51.26 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  51.5 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  50.58 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  50.58 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  50.35 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  50.11 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  50.58 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  50.34 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  49.66 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  48.72 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  48.96 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  50 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  50.58 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  49.43 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  50.57 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  50.34 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  49.43 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  47.26 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  48.87 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  47 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  47.33 
 
 		 448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  45.75 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  45.77 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  45.75 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  45.21 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0380  N-acetylglutamate synthase  47.17 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  45.75 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  43.76 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  45.75 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  45.75 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  45.75 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  44.6 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  45.12 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  43.71 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  43.86 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0360  N-acetylglutamate synthase  45.02 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  45.43 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  45.12 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  45.43 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  47.36 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  43.96 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  43.94 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  43.48 
 
 		 465 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  43.21 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  42.95 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.706151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>