More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0685 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1901  N-acetylglutamate synthase  70.56 
 
 		 456 aa  676    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0685  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 		 449 aa  922    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.98957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002688  N-acetylglutamate synthase  71.24 
 
 		 445 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03295  N-acetylglutamate synthase  70.98 
 
 		 448 aa  681    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  67.19 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  67.19 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  67.19 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.781275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  66.52 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  66.52 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  66.52 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  66.52 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  66.74 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  66.52 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3261  N-acetylglutamate synthase  66.29 
 
 		 443 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  66.52 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  66.52 
 
 		 443 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4083  N-acetylglutamate synthase  66.29 
 
 		 443 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  65.91 
 
 		 441 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  64.48 
 
 		 443 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3204  N-acetylglutamate synthase  64.48 
 
 		 443 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  64.72 
 
 		 441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3318  N-acetylglutamate synthase  64.48 
 
 		 443 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3218  N-acetylglutamate synthase  64.48 
 
 		 443 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  63.96 
 
 		 443 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0919  N-acetylglutamate synthase  64.72 
 
 		 441 aa  601  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  64.27 
 
 		 441 aa  591  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  64.48 
 
 		 441 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  60.81 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  60.36 
 
 		 445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  60.72 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  60.72 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  60.72 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  60.27 
 
 		 439 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  60.72 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  60.59 
 
 		 445 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  60.36 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  60.22 
 
 		 440 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0329  N-acetylglutamate synthase  59.82 
 
 		 439 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.758778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  59.64 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  59.82 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3478  N-acetylglutamate synthase  59.46 
 
 		 440 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  60.05 
 
 		 440 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0388  N-acetylglutamate synthase  58.92 
 
 		 439 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0404545  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  53.17 
 
 		 444 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  52.19 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  51.04 
 
 		 432 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  50.12 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  50.12 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  50.12 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  50.35 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  49.42 
 
 		 432 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  50.11 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  50.12 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  49.89 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  49.88 
 
 		 432 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  49.88 
 
 		 432 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  50.34 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  48.96 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  51.03 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  49.88 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  48.87 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  47.58 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  48.16 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0360  N-acetylglutamate synthase  47.7 
 
 		 439 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  47.81 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  47.58 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  46.59 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  44.9 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  44.34 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  44.94 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  44.77 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  44.85 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  45 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  44.17 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0380  N-acetylglutamate synthase  45.91 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  44.65 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  45 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  44.42 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  43.21 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  43.18 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  43.18 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  43.84 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  43.84 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  43.51 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  43.84 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  43.84 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  43.6 
 
 		 448 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  44.06 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  43.84 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  43.84 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  43.84 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  43.51 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2228  N-acetylglutamate synthase  41.4 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  43.61 
 
 		 478 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  43.05 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  42.82 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  43.05 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  43.05 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  43.05 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>