23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37215 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37215  predicted protein  100 
 
 
486 aa  997    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43491  predicted protein  31.71 
 
 
563 aa  239  9e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00664754  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37109  predicted protein  32.42 
 
 
539 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  24.11 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  23.47 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  23.31 
 
 
464 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 
442 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  19.47 
 
 
453 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  19.28 
 
 
474 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  19.71 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
419 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  21.78 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  22.62 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
469 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  22.25 
 
 
447 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 
458 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
572 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  23.86 
 
 
425 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  22.45 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  21.65 
 
 
448 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  22.27 
 
 
440 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
441 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>