More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11934 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_11934  predicted protein  100 
 
 		 74 aa  150  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  66.22 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  63.51 
 
 		 73 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  63.51 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4936  translation initiation factor IF-1  62.16 
 
 		 73 aa  94.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000594516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 72 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 72 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 72 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 72 aa  94  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 72 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  59.46 
 
 		 73 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 72 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 73 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 72 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 72 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 72 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 72 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 72 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  57.53 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  56.76 
 
 		 85 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  56.76 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 72 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  59.46 
 
 		 72 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 75 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 73 aa  90.1  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  90.1  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 73 aa  90.5  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 75 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 75 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 72 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 73 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 73 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  60.81 
 
 		 72 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  60.81 
 
 		 72 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  56.76 
 
 		 73 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 72 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  58.11 
 
 		 72 aa  88.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 73 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  55.56 
 
 		 72 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  56.76 
 
 		 73 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  59.46 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  52.7 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  54.05 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  55.41 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>