17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2380 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2380  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980429  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2010  hypothetical protein  27.83 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  23.83 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1650  hypothetical protein  28.9 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134498  normal  0.369748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  27.4 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  27.8 
 
 
321 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  25.73 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  25.45 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  22.73 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  26.03 
 
 
246 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  24.64 
 
 
246 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  28.33 
 
 
294 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  25.4 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1481  hypothetical protein  23.76 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2943  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443627  normal  0.462876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1667  hypothetical protein  22.16 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>