15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1428 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  544  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  52.67 
 
 
245 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  50.61 
 
 
246 aa  269  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  46.56 
 
 
245 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  50.87 
 
 
246 aa  246  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  44.4 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  47.06 
 
 
246 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  28.57 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  26.94 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  25.99 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  27.47 
 
 
321 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  27.44 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  23.58 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1927  hypothetical protein  25.49 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000210068  hitchhiker  0.00302398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2380  hypothetical protein  23.83 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980429  normal  0.518017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>