16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1581 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  567  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  59.12 
 
 
273 aa  324  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  41.58 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  39.01 
 
 
321 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  33.09 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  28.57 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  29.86 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  27.35 
 
 
246 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  28.95 
 
 
245 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  27.31 
 
 
246 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  26.43 
 
 
246 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  26.55 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  26.03 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1927  hypothetical protein  27.95 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000210068  hitchhiker  0.00302398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2010  hypothetical protein  27.83 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4078  hypothetical protein  23.89 
 
 
194 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0303334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>