15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0850 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  513  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  68.29 
 
 
246 aa  367  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  57.92 
 
 
245 aa  304  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  55.92 
 
 
245 aa  298  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  52.67 
 
 
246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  53.1 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  47.06 
 
 
264 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  29.18 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  30.58 
 
 
273 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  28.38 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  25.86 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  27.85 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  22.75 
 
 
261 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2380  hypothetical protein  26.96 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980429  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1927  hypothetical protein  27.5 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000210068  hitchhiker  0.00302398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>