19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28900 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28900  predicted protein  100 
 
 		 593 aa  1215    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86258  predicted protein  29.8 
 
 		 262 aa  97.4  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.94 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.65 
 
 		 988 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2987  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 266 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.93 
 
 		 1056 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11391  predicted protein  34.88 
 
 		 148 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.21 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29 
 
 		 1022 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  28.23 
 
 		 269 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 818 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43955  TRP-containing protein  28.57 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0248757  normal  0.0716262 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2192  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  38.96 
 
 		 276 aa  44.3  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 289 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 376 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 292 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 292 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>