52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0698 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0698  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177114  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0060  tRNA-Glu  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000173097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0059  tRNA-Glu  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0413  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000518096  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0659  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000134857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0072  tRNA-Glu  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0063  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0031  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0414  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0616515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0173  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0024  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1865  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1320  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.193147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2174  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.333692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0557  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0102233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0022  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0023  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0506  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0002  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00190124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0023  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.805524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0073  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0583233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  86 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>