22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4284 on replicon NC_013925
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013925  Nmag_4284  integrase family protein  100 
 
 
224 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  25.12 
 
 
302 aa  55.1  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  34.72 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  24.51 
 
 
301 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.27 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  31.15 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  29.87 
 
 
307 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  23.32 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.2 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  30.49 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  29.76 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  31.25 
 
 
323 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.95 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  30.77 
 
 
291 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  31.25 
 
 
417 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.05 
 
 
309 aa  42.7  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.88 
 
 
295 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  35.14 
 
 
295 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  22.89 
 
 
305 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  30.99 
 
 
304 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.56 
 
 
310 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.48 
 
 
332 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>