18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4609 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4609    100 
 
 		 1467 bp  2908    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  90.32 
 
 		 2190 bp  75.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 2223 bp  63.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 		 2223 bp  63.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  100 
 
 		 2223 bp  63.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  97.06 
 
 		 2313 bp  60  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  97.06 
 
 		 2331 bp  60  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  97.06 
 
 		 2394 bp  60  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  97.06 
 
 		 2313 bp  60  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  97.06 
 
 		 2331 bp  60  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  97.06 
 
 		 2028 bp  60  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  96.97 
 
 		 2277 bp  58  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  96.88 
 
 		 2226 bp  56  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  96.88 
 
 		 2223 bp  56  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  86.11 
 
 		 2172 bp  56  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  96.88 
 
 		 2223 bp  56  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  93.75 
 
 		 2223 bp  48.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  93.75 
 
 		 2151 bp  48.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>