28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3985 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3985  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  90 
 
 		 343 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  76.67 
 
 		 343 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  62.16 
 
 		 336 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1396  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 346 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.199671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1747  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 346 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 346 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  52.38 
 
 		 342 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 342 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 342 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 342 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  52.38 
 
 		 342 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.77 
 
 		 341 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3762  putative transposase  76.92 
 
 		 341 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.915156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  66.67 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.29 
 
 		 338 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  60.71 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  64.29 
 
 		 348 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.29 
 
 		 348 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 		 333 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 		 341 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>