32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3516 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  343  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.066418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2721  hypothetical protein  75.46 
 
 		 162 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6885  hypothetical protein  72.12 
 
 		 162 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120825  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4757  hypothetical protein  68.48 
 
 		 156 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4153  hypothetical protein  67.07 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0293602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1305  hypothetical protein  66.06 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1806  hypothetical protein  67.07 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586351  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3071  hypothetical protein  56.72 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.192649  normal  0.478778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1084  hypothetical protein  42.34 
 
 		 136 aa  94.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389203  normal  0.629559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0884  hypothetical protein  43.55 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789446  normal  0.18909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3008  hypothetical protein  40.62 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1177  hypothetical protein  42.19 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1298  hypothetical protein  42.31 
 
 		 136 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.675467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2641  hypothetical protein  42.31 
 
 		 136 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3712  hypothetical protein  39.01 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1905  hypothetical protein  40.62 
 
 		 139 aa  85.1  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3311  hypothetical protein  40.3 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0806  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2846  hypothetical protein  39.34 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3234  hypothetical protein  37.31 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2973  hypothetical protein  36.57 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2114  hypothetical protein  36.11 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2030  hypothetical protein  36.11 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0017  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2709  hypothetical protein  31.88 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2936  hypothetical protein  31.88 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.0164509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4278  hypothetical protein  35.94 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3951  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2831  hypothetical protein  32.12 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0669  hypothetical protein  31.69 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1999  hypothetical protein  35.38 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151005  normal  0.140541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>