32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3951 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3951  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  295  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4278  hypothetical protein  93.75 
 
 
144 aa  280  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3234  hypothetical protein  69.23 
 
 
141 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0017  hypothetical protein  61.9 
 
 
148 aa  177  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0806  hypothetical protein  61.11 
 
 
151 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0669  hypothetical protein  70.54 
 
 
138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2030  hypothetical protein  59.31 
 
 
148 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2114  hypothetical protein  59.31 
 
 
148 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3712  hypothetical protein  39.31 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3311  hypothetical protein  40.88 
 
 
188 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3008  hypothetical protein  38.76 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1905  hypothetical protein  41.73 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3071  hypothetical protein  42.28 
 
 
147 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.192649  normal  0.478778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2641  hypothetical protein  40.87 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1298  hypothetical protein  40.87 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.675467  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1084  hypothetical protein  36.36 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389203  normal  0.629559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1177  hypothetical protein  38.79 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695583  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2973  hypothetical protein  38.21 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763953  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0884  hypothetical protein  38.14 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789446  normal  0.18909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2721  hypothetical protein  33.08 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2709  hypothetical protein  31.85 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2831  hypothetical protein  32.33 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2936  hypothetical protein  31.85 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.0164509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1305  hypothetical protein  34.53 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4757  hypothetical protein  35.66 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4153  hypothetical protein  35.43 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0293602  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6885  hypothetical protein  34.07 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120825  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2846  hypothetical protein  35.96 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3516  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.066418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1806  hypothetical protein  34.4 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586351  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0468  hypothetical protein  35.9 
 
 
139 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1999  hypothetical protein  37.61 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151005  normal  0.140541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>