32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1305 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1305  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4153  hypothetical protein  89.74 
 
 		 156 aa  286  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0293602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1806  hypothetical protein  88.46 
 
 		 156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586351  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4757  hypothetical protein  73.72 
 
 		 156 aa  233  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6885  hypothetical protein  65.84 
 
 		 162 aa  203  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120825  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3516  hypothetical protein  65.45 
 
 		 165 aa  197  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.066418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2721  hypothetical protein  64.38 
 
 		 162 aa  193  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3071  hypothetical protein  51.39 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.192649  normal  0.478778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1177  hypothetical protein  44.53 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2641  hypothetical protein  46.21 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1298  hypothetical protein  46.21 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.675467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3008  hypothetical protein  47.06 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1084  hypothetical protein  42.52 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389203  normal  0.629559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0884  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789446  normal  0.18909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1905  hypothetical protein  45.6 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0806  hypothetical protein  38.03 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2114  hypothetical protein  36.76 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2030  hypothetical protein  36.76 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2846  hypothetical protein  40.34 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3311  hypothetical protein  36.97 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3712  hypothetical protein  35.97 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3234  hypothetical protein  34.04 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0017  hypothetical protein  34.85 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3951  hypothetical protein  34.53 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4278  hypothetical protein  36.15 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2973  hypothetical protein  36.57 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0669  hypothetical protein  33.8 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2936  hypothetical protein  34.09 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.0164509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2709  hypothetical protein  34.09 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2831  hypothetical protein  34.38 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0468  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1999  hypothetical protein  34.81 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151005  normal  0.140541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>