32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3071 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3071  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.192649  normal  0.478778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4757  hypothetical protein  58.73 
 
 
156 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6885  hypothetical protein  52.82 
 
 
162 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120825  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2721  hypothetical protein  55.28 
 
 
162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3516  hypothetical protein  52.17 
 
 
165 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.066418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1806  hypothetical protein  57.58 
 
 
156 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586351  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4153  hypothetical protein  54.81 
 
 
156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0293602  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1305  hypothetical protein  51.39 
 
 
155 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1177  hypothetical protein  51.54 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695583  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3008  hypothetical protein  49.23 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1298  hypothetical protein  50.39 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.675467  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0884  hypothetical protein  53.08 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789446  normal  0.18909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2641  hypothetical protein  50.39 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1905  hypothetical protein  51.72 
 
 
139 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1084  hypothetical protein  48.15 
 
 
136 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389203  normal  0.629559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2846  hypothetical protein  47.15 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0806  hypothetical protein  41.3 
 
 
151 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4278  hypothetical protein  44.72 
 
 
144 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3234  hypothetical protein  41.09 
 
 
141 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3951  hypothetical protein  42.28 
 
 
144 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3311  hypothetical protein  40.15 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0669  hypothetical protein  42.5 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2114  hypothetical protein  38.64 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2030  hypothetical protein  38.64 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3712  hypothetical protein  40.3 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2709  hypothetical protein  35.04 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2936  hypothetical protein  35.04 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.0164509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2973  hypothetical protein  38.52 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763953  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0017  hypothetical protein  34.11 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2831  hypothetical protein  34.07 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0468  hypothetical protein  39.66 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1999  hypothetical protein  36.52 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151005  normal  0.140541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>