32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2973 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2973  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2831  hypothetical protein  64.33 
 
 
172 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2709  hypothetical protein  66.24 
 
 
159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2936  hypothetical protein  66.24 
 
 
159 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  0.0164509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0468  hypothetical protein  62.68 
 
 
139 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1999  hypothetical protein  64.58 
 
 
139 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151005  normal  0.140541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0806  hypothetical protein  44.54 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4278  hypothetical protein  40.5 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735396  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3712  hypothetical protein  39.86 
 
 
142 aa  84.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3311  hypothetical protein  38.73 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3951  hypothetical protein  38.21 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3234  hypothetical protein  38.33 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3516  hypothetical protein  35.66 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.066418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0017  hypothetical protein  38.06 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3008  hypothetical protein  37.7 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1806  hypothetical protein  39.01 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586351  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2721  hypothetical protein  34.38 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6885  hypothetical protein  35.29 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120825  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4757  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3071  hypothetical protein  38.52 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.192649  normal  0.478778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1305  hypothetical protein  36.57 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4153  hypothetical protein  37.01 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0293602  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0669  hypothetical protein  40.98 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2030  hypothetical protein  41.32 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1177  hypothetical protein  37.29 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695583  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2114  hypothetical protein  41.32 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1905  hypothetical protein  35.59 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1298  hypothetical protein  37.1 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.675467  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2641  hypothetical protein  37.1 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331796  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1084  hypothetical protein  31.36 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389203  normal  0.629559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2846  hypothetical protein  34.71 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0884  hypothetical protein  32.2 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789446  normal  0.18909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>