25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3748 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3748  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2499  hypothetical protein  49.87 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4047  hypothetical protein  44.25 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.403279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4859  hypothetical protein  41.49 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4948  hypothetical protein  41.49 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5454  hypothetical protein  38.7 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5227  hypothetical protein  41.49 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1338  hypothetical protein  40.57 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1409  hypothetical protein  40.15 
 
 		 386 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  decreased coverage  0.00798982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09310  hypothetical protein  37.79 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13722  hypothetical protein  36.66 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.471564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7597  secreted protein  39.48 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  hitchhiker  0.00981845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3818  hypothetical protein  39.83 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2446  hypothetical protein  32.88 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2517  hypothetical protein  35.2 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0760  hypothetical protein  35.77 
 
 		 489 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1846  hypothetical protein  29.78 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2335  hypothetical protein  36.59 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0462742  decreased coverage  0.000000721726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2715  hypothetical protein  34.86 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151784  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1831  hypothetical protein  29.8 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3909  secreted protein  33.42 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20680  hypothetical protein  35.17 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5845  hypothetical protein  32.6 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142107  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4820  hypothetical protein  29.73 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0073  hypothetical protein  33.04 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>