24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5454 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5454  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1338  hypothetical protein  74.6 
 
 
382 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4859  hypothetical protein  64.74 
 
 
363 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4948  hypothetical protein  64.74 
 
 
363 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216046  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5227  hypothetical protein  64.74 
 
 
363 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13722  hypothetical protein  58.89 
 
 
359 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.471564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4047  hypothetical protein  41.94 
 
 
388 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.403279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1409  hypothetical protein  45.69 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  decreased coverage  0.00798982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2499  hypothetical protein  43.7 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7597  secreted protein  40.7 
 
 
377 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  hitchhiker  0.00981845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2517  hypothetical protein  38.14 
 
 
389 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3818  hypothetical protein  36.61 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09310  hypothetical protein  33.82 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2446  hypothetical protein  36.17 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3748  hypothetical protein  38.7 
 
 
404 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2715  hypothetical protein  37.06 
 
 
401 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151784  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1831  hypothetical protein  33.2 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0760  hypothetical protein  39.77 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2335  hypothetical protein  39.33 
 
 
396 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0462742  decreased coverage  0.000000721726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1846  hypothetical protein  28.35 
 
 
440 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3909  secreted protein  32.07 
 
 
371 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5845  hypothetical protein  30.16 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142107  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4820  hypothetical protein  29.77 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20680  hypothetical protein  30.13 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>