24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0760 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0760  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5845  hypothetical protein  49.21 
 
 
474 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142107  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4859  hypothetical protein  35.51 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5227  hypothetical protein  35.51 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4948  hypothetical protein  35.51 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216046  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4047  hypothetical protein  38.11 
 
 
388 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.403279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5454  hypothetical protein  39.77 
 
 
379 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1338  hypothetical protein  35.56 
 
 
382 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7597  secreted protein  38.36 
 
 
377 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  hitchhiker  0.00981845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2715  hypothetical protein  34.38 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13722  hypothetical protein  40.25 
 
 
359 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.471564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1831  hypothetical protein  32.39 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156159  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09310  hypothetical protein  35.62 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3818  hypothetical protein  36.49 
 
 
392 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1846  hypothetical protein  29.97 
 
 
440 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1409  hypothetical protein  35.13 
 
 
386 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  decreased coverage  0.00798982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2446  hypothetical protein  39.83 
 
 
396 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2499  hypothetical protein  34.72 
 
 
382 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3909  secreted protein  31.32 
 
 
371 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2335  hypothetical protein  36.98 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0462742  decreased coverage  0.000000721726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2517  hypothetical protein  33.43 
 
 
389 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4820  hypothetical protein  29.38 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3748  hypothetical protein  35.94 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20680  hypothetical protein  35.63 
 
 
404 aa  60.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>